Em Alvin e os Esquilos 3, os adoráveis irmãos esquilos Alvin, Simon e Theodore embarcam em uma emocionante viagem de cruzeiro que promete muita diversão. Acompanhados de seu responsável, Dave, e das esquiletes – Brittany, Jeanette e Eleanor – eles estão prontos para aproveitar o verão. No entanto, a travessura de Alvin acaba levando todos para uma ilha desconhecida, criando uma série de situações hilárias e desafiadoras. Enquanto isso, Dave tenta lidar com o caos e resgatar os esquilos, com o ajuda involuntária de Ian, o ex-empresário que agora desempenha um papel cômico como pelicano em um cruzeiro. A mistura de aventuras, novas amizades e uma pitada de rivalidade entre os personagens adiciona uma camada intrigante ao enredo. Os espectadores se perguntam se, ao final, o espírito de equipe triunfará sobre as travessuras de Alvin e, por consequência, sobre os desafios inesperados que a ilha oferece.
